祝乾寿是明朝抗击倭寇、保家卫国的好县令。他在任之时，是昆山抗倭斗争最为艰苦的时期。在抗击倭寇方面，他嫉恶如仇，率领昆山居民血战四十六天，生擒倭寇头目，最终震退敌军，保住了昆山县城；在管理内政方面，他爱民如子，任内对民众以教育和感化为主，断案公允，不曾冤枉一个好人，受到昆山民众的爱戴。

     祝乾寿，字健卿，号斗南，应城人，小时候聪明伶俐，生性机敏，爱好读书习文。据说他少年之时在屋里读书，读书之余感觉疲倦稍事休息，忽然看见一个美貌的妇人嫣然一笑，进得门来，好象准备与他嬉戏逗乐。美貌妇人伫立良久，对他凝眸注视，见祝乾寿不为所动，就从墙头上隐去了。老人们说，那个地方有狐狸精，每次幻形都要骗一些人，而祝乾寿没有被骗，说明他德行如一、志向高远。

     祝乾寿在明朝嘉靖二十八年（ 1549 年）时，中了举人；三十二年（ 1553 年），又中了进士。有一个同榜中进士的许从龙，投奔在当时的大奸臣严嵩门下。祝乾寿等人以此为耻，两人之间产生了隔阂和分歧。后来祝乾寿赴京城，偶然遇到许从龙，与他一起下棋，正好棋子争路，乾寿嘲笑他说：“你想倚仗宰相这座冰山来倾轧我吗？”许从龙恼羞成怒，记恨在心，多次想报复祝乾寿，又找不到合适的机会。他在严嵩面前尽说祝乾寿的坏话，企图借严嵩之手置祝乾寿于死地。果然，严嵩为了给许从龙泄忿，授意吏部，将祝乾寿调到城垣残破又常遭倭寇侵袭的江苏昆山县城做县令。

     昆山是苏州附近的一个县城，而苏州是当时全国最繁华富裕的城市，“水陆孔道，商贾骈集，货物山积”，河内货船樯帆林立，岸边屋舍鳞次栉比，也是凶悍的倭寇垂涎的目标。倭寇起源于日本的海盗。 14 世纪，日本南北朝分裂，天皇失权，诸侯纷争。失败的南朝诸侯，收罗武士浪人，带着武器，从东南沿海流窜入浙江、福建、江苏一带富庶之地，并与内地盗匪勾结，烧杀抢掠，无恶不作，史称“倭患”。东南沿海倭患，从嘉靖三十一年（ 1552 年）开始到嘉靖四十五年（ 1566 年）嘉靖皇帝逝世为止，前后约十五年，其中嘉靖三十一年（ 1552 年）至三十八年（ 1559 年）的八年，是江南地区抗倭斗争最为艰苦也最为惨烈的八年。祝乾寿从嘉靖三十三年（ 1554 年）就任昆山县令，已经是受命于危难之际。当时昆山抗倭的形势相当严峻，归有光在《备倭事略》里说：“夫苏州之守，不在于娄门，而在于昆山、太仓。”可见昆山战略位置的重要。嘉靖三十三年正月，大规模的倭乱发生于江南地区，倭寇从太仓出海，转掠苏州、松江两地，直扫昆山。

     倭寇以五十多艘大船和三千多军士的兵力，闯进浏河口，袭击昆山县城。祝乾寿刚到任昆山，就招募壮丁，修葺城墙上的残垣断壁，以作防御之用，还精选兵力，昼夜巡城守卫。不久，倭寇逼进昆山城，将城团团围住，集中兵力攻打西门。因攻守敌我兵力悬殊，守城壮丁体力不支，寡不敌众，被敌方突围进入城门之中。祝乾寿听到这一消息，亲自冒着如雨的弓箭和石头，率领精锐兵士殊死堵截，血战一天，方才夺回城门。当时敌方气焰非常嚣张，将城围住不退兵，并不时对各个城门进行骚扰和攻击。祝乾寿临危不惧，站在城头临阵指挥，敌方每逢来攻，马上命令精锐勇士弓箭齐发，夹杂火器，继而用石块和滚木向城下压去，倭寇死伤很多，不得不撤退，昆山城得以保全。祝乾寿知道倭寇还会来犯，抓住战斗的间隙，修补城墙，补充武器，作好长久的御敌打算。他以身作则，日日夜夜巡城防守不松懈，时时刻刻提高警惕防不测。士兵在他的激励下，士气高涨，誓与城池共存亡。不久，倭寇再次来犯，此次来势更猛，轮番攻城，日夜不停。祝乾寿听从昆山父老的教导，用滚沸的桐油掺杂厕所的粪便泼向城墙下围攻的倭寇，许多敌人被烫伤。祝乾寿率领精锐兵力，乘胜追击，出城追杀数十里，斩掉倭寇首级数百人，还活捉了匪首二大王，倭寇惧怕不已，作鸟兽散，昆山才解围城之难。此次战役昆山城被围足足有四十六天，祝乾寿率全城军民奋起还击，同仇敌忾，最后以倭寇溃败告终。于是朝臣纷纷上书，称祝乾寿“血战完城，惠政得民，为令第一”。
     为官一任，造福一方，是祝乾寿一生做官的真实写照。祝乾寿履职昆山之时，对待士兵下属宽容大度，与他们同甘共苦，遇到士兵下属受伤，他会亲自上门看望慰问，士兵常常感动得流泪。祝乾寿还注重张布告示，安抚民心。尽管倭寇不时来犯，但城内民心稳定，市面如平常一样。他教育感化民众方法得当，施政颇得民心，遇事果断，断案公允，不曾冤枉一个好人，得到昆山人民的拥戴。祝乾寿任昆山县令仅仅一年，因父亲去世，报告朝廷，回家守制。在他离任的一天，送他的昆山民众站满了他回乡的道路，相送几十里。